Aralik 2021
Kolorektal kanserde lncRNA DPP10-AS1 ekspresyonu tümör baskilayici ve tümör mikro çevresinde metabolit transportuyla iliskili olabilir mi?
Could lncRNA DPP10-AS1 expression in colorectal cancer be associated with tumor suppressor and metabolite transport in the tumor microenvironment?
- Ana Sayfa
- Sayılar
- Aralik 2021
- Kolorektal kanserde lncRNA DPP10-AS1 ekspresyonu tümör baskilayici ve tümör mikro çevresinde metabolit transportuyla iliskili olabilir mi?...
2Biruni Üniversitesi Tip Fakültesi, Tibbi Biyokimya Anabilim Dali, Istanbul
Özet
Giris ve Amaç: Onkogen ve tümör baskilayici gen ifadeleri basta olmak üzere birçok ribonükleik asit ve proteinle moleküler etkilesimde bulunabilen uzun kodlanmayan ribonükleik asitler solid organ kanserlerinde iliskilendirilmeye baslanmistir. Deneysel çalismalarda Wingless ile ilgili entegrasyon bölgesi/beta-katenin yolagi ile iliskilendirilen uzun kodlanmayan ribonükleik asit DPP10-AS1’in çalismamizda kolorektal tümörlerdeki ifadesi ve serum biyobelirteçleriyle olan iliskisinin incelenmesi amaçlanmistir. Gereç ve Yöntem: Kolorektal kanser tanili elli bir olgunun tümör ve tümörsüz çevre dokusuna ait formalinle fikse edilmis parafine emdirilmis bloklarindan total ribonükleik asit izolasyonu gerçeklestirildi. Izole edilen total ribonükleik asitten uzun kodlanmayan ribonükleik asitlere spesifik c-deoksiribonükleik asit sentezi gerçeklestirildikten sonra DPP10-AS1’e özgü primerler ile gerçek zamanli polimeraz zincir reaksiyonu ile ekspresyon düzeyi tespit edildi. Ekspresyon düzeyleri olgularin serum biyobelirteçleriyle korelasyon yönünden incelendi. Bulgular: Uzun kodlanmayan ribonükleik asit DPP10-AS1’in katli degi simi tümörsüz çevre dokusunda tümör dokusuna göre yaklasik 5.7 kat yüksek oldugu tespit edilmistir (p = 0.0002). Histopatolojik bulgularla uzun kodlanmayan ribonükleik asit DPP10-AS1 arasinda istatistiksel bir farklilik tespit edilmezken, uzak organ metastazi olmayanlarda olanlara göre 1.5 kat yüksek oldugu izlenmistir (p > 0.05). DPP10-AS1 ile albümin (r: ,403; p = 0.033) ve amilaz (r: ,450; p = 0.031) arasinda pozitif korelasyonlar tespit edildi. Sonuç: DPP10-AS1’in tümör baskilayici rolü oldugunu, albüminle korelasyonu tümör mikro çevresinde sekonder metabolitlerin transportunda rol oynayabilecegini düsündürmektedir. DPP10-AS1 ile amilaz korelasyonunun literatürde tanimlanan yüksek amilaz düzeylerinin tümör farklilasmasi, çogalmasi sürecindeki etkisiyle paralel sekilde tümör mikro çevresinin bir yaniti olarak ifade edilebilecegini düsünmekteyiz
Abstract
Background and Aims: Long non coding ribonucleic acid, which can interact with many RNAs and proteins-especially oncogene and tumor suppressor gene expressions-have begun to be associated with solid organ cancers. This study was conducted with the objective to examine the expression of long non coding ribonucleic acid, DPP10-AS1, which is associated with the Wnt/?-catenin pathway in experimental studies, in colorectal tumors and its relationship with serum biomarkers. Materials and Methods: Total ribonucleic acid isolation was performed from formalin-fixed paraffin-impregnated blocks of tumor and tumor-free surrounding tissue of 51 patients with colorectal cancer. After specific c-deoxyribonucleic acid synthesis was performed from the isolated total ribonucleic acids to Long non coding ribonucleic acids, theexpression level was determined by real-time polymerase chain reaction with primers specific to DPP10-AS1. Expression levels were analyzed interms of correlation with serum biomarkers of the cases. Results: The fold change in long non coding ribonucleic acid DPP10-AS1 was found to be approximately 5.7 times higher in tumor-free surrounding tissue than in tumor tissue (p = 0.0002). While no statistical difference was detected between histopathological findings and long non coding ribonucleic acid, DPP10-AS1, it was observed to be 1.5 times higher in patients without distant organ metastasis (p > 0.05). Positive correlations were detected between DPP10-AS1 and albumin (r: .403; p = 0.033) as well as between DPP10-AS1 and amylase (r: .450; p = 0.031). Conclusion: DPP10-AS1 has a tumor suppressive role, and its correlation with albumin suggests that it may play a significant role in the transportation of secondary metabolites in the tumor microenvironment. The results suggests that the correlation between DPP10-AS1 and amylase can be expressed as a response of the tumor microenvironment in parallel with the effect of high amylase levels on tumor differentiation and proliferation, as defined in the literature
